La Unidad de investigación es el órgano de línea de la Facultad de Ingeniería Ambiental encargado de conducir y desarrollar todas las actividades inherentes al campo de la investigación que se desarrollan según las líneas de investigación concernientes a la Facultad, prioritarias para el País y para la protección ambiental.
En ese sentido, dada la trayectoria y prestigio institucional de la UNI, y en beneficio al crecimiento de la facultad, sus docentes (de las tres escuelas) puedan proponer y desarrollar proyectos que contribuyan con la generación de conocimiento, su implementación, proporcionen una mejora en sus condiciones económicas y además permitan a través del apoyo y participación de alumnos y tesistas la contribución de este estamento en el desarrollo de la FIA.